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Cluster를 위한 ssh무인증 설정하기./ 주의사항. 공개키 관리 철저하게 합시다! ㅋㅋㅋ 우선 먼저 마스터노드 작업... (내경우 이름이 node1임) node1$>vi /etc/ssh/sshd_config 을 쳐서 sshd_config파일을 수정하자 ... #port 22 ... #RSAAuthentication yes #PubkeyAuthentication yes #AuthorizedKeysFile .ssh/authorized_keys 이 4곳의 #을 제거하여(주석처리 해제하여) 활성화 시킨후 :wq명령으로 나가자 service sshd restart로 sshd를 재시작 그리고 이제 홈디렉토리로 가자. ssh-keygen -t rsa로 키파일을 만들자 파일이름을 입력하라고 나온다 (걍 엔터치면 default값인. /root/.ssh/id_r.. 2008. 7. 4.
MPICH1 버그 좀만 배열크기 커져도... mpirun.ch_p4 243 : segmentatio fault가 나네... 문의메일 보내니까.. MPICH1보다는 MPICH2를 추천한다... 너도 MPICH2를 써라 이렇게 답신이왔네.. 이거 뭥ㅁ? 2008. 7. 2.
MPICH설치라는 삽질후기 mpich1.2.7-p1.tar.gz2를 tar -zxvf 옵션으로 압축을 풀었다.. 그리고 나는 Intel컴파일러 (CC,FC전부 Intel 10.1.015버전의것을 사용함. 설치는 미리했음)를 기본으로 해서 컴파일 할 것이므로 옵션을 지정해 주었다 mpich1.2.7-p1>./configure --prefix=/usr/mpich/ -cc=icc -f90=ifort -f77=ifort -fc=ifort -cflags='-no-multibyte-chars' -fflags='-no-multibyte-chars' 로 configure 실행. 이외에 옵션을 더 수정해야할것 같긴하지만 내가 잘 모르는 관계로.. 패쓰..-_-; make 하였다.. (여기서 오류가 나면 ./configure를 옵션을 다시 지정해서.. 2008. 6. 27.
Intel Compiler 10.1.015 + SPECMPI2007 configfile FC=mpif90 (mpif90/mpif77은 ifort를 기본으로 삼도록 지정하여 mpich빌드) CC=mpicc (mpicc는 icc를 기본으로 삼도록 지정하여 mpich빌드) CXX=mpicpc #Portability Flags 127.wrf2=default=default=default: CPORTABILITY=-DSPEC_MPI_CASE_FLAG -DSPEC_MPI_LINUX -DSPEC_MPI_DOUBLE_UNDERSCORE -DF2CSTYLE #Optimization flags OPTIMIZE = -Ofast submit = mpirun -m 2 -disable-mpi-progress-check -np 3 $command 이것이 현재의 빌드 옵션들... 이번에도 mpirun.. 2008. 6. 27.
SPEC MPI2007 설치... FC4에서 해볼라고 아주-_-; 삽을 떴다... 다행히 glibc와 gcc를 업글하고 perl-5.8.8설치하고 나니... 그리고 mpi2007.tar.bz2파일을 직접 풀어서 설치하니 redhat_ia32로 설치 잘되었음.. 근데 문제는...-_- gcc와 g95를 사용하여 컴파일 하려니까.... 아주 사람 미친다는거-_- 2008. 6. 18.
OpenPBS 2.3.16 빌드하기.. OpenPBS 2.3.16을 다운로드 한다 (다운로드는 http://www.openpbs.org 이곳으로 가면 찾을수있을듯) 그리고 openpbs-error.patch와 openpbs-gcc32.patch를 역시 같이 다운받는다. 그리고 다운받은 openpbs.tar.bz2(혹은 gz) 을 압축을 해제한다. bzip2 -d openpbs.tar.bz2 | -xf인가 tar xf인가를 활용하거나 아니면 bzip2 -d openpbs.tar.bz2 한후 tar xvf openpbs.tar로 풀어낸다. openpbs(압축푼디렉토리)디렉토리에 다운받은 패치파일 두개를 복사한다. openpbs디렉토리로 이동하여 패치를 우선 수행한다 patch -p1 < openpbs-error.patch patch -p1 < o.. 2008. 6. 16.
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